Lors du Nintendo Direct du 13 février 2019, Nintendo a annoncé une mise à jour pour Captain Toad : Treasure Tracker, disponible immédiatement. Elle permet de jouer à deux sur les niveaux où il n'était possible de jouer qu'avec Captain Toad auparavant. Ainsi les niveau pourront être parcourus avec un Toad violet qui pourra être contrôlé par une seconde joueuse ou un second joueur. Une partie de l'aventure pourra aussi être jouée à deux avec Toadette.
Le 14 mars 2019 paraîtra un contenu téléchargeable qui contiendra 18 nouveaux défis, 5 nouveaux stages et de nouveaux objectifs dans les stages déjà présents dans le jeu.