Le jeu prend place dans le royaume d'Hyrule, ancienne terre où vivait le peuple des Hyliens. C'était un monde de forêts, de lacs et de montagnes. 7 sages protègent le trésor de cette Terre d'Or, la Triforce, qui permet d'exaucer les souhaits de celui qui la touche. Les descendants des 7 sages seront kidnappés par Ganondorf qui veut s'emparer de la terre d'Or en créant une brèche entre le monde des ténèbres et le monde de la lumière.