Différent des précédentes adaptations vidéoludiques de la franchise Alien, Alien: Isolation met en avant des éléments d’infiltration et de survival horror ; le joueur se doit d’éviter ou de repousser des créatures aliens, des androïdes ou même des hors-la-lois tout au long du jeu. Le scénario du jeu se situe entre Alien, le huitième passager et Aliens, le retour. L'univers graphique se rapproche davantage du film de Scott.